Le projet entretient des relations avec les autres chercheurs de l'Inria participant aux études autour des génomes, en particulier avec J.-J. Codani et F. Rechenmann.
S. Grumbach et F. Tahi participent, dans le cadre de l'action Génome, aux recherches entreprises dans le thème Informatique et Génome [14]. (Voir le rapport d'activité, Action Transversale Génome et Calcul).
M. Scholl a été membre du conseil scientifique du Groupement d'Etudes et Recherches sur les Génomes (GREG) qui coordonne et finance les recherches françaises sur le génome, jusqu'à septembre, date de disparition de la bio-informatique dans la liste des compétences du GREG. Il est également membre du comité de pilotage du GIP Infobiogen.