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Modélisation des connaissances en
biologie
Participants : Florence Lemaire, François Rechenmann
Le processus incrémental et coopératif de construction d'une base de connaissances scientifiques, par exemple en biologie moléculaire, soulève le problème de l'intelligibilité du contenu de la base pour un spécialiste qui n'a pas participé à son élaboration [2].
Trois types d'information nécessaires à la compréhension des connaissances représentées ont été identifiés : définition de la terminologie, justification de la validité scientifique des connaissances et explication des choix de modélisation effectués. Pour que ces trois types d'informations soient accessibles à partir des connaissances formalisées, nous proposons un environnement informatique composé de quatre bases : une base de connaissances, une base de modélisation, une base de textes et une base terminologique. Cette dernière, SiLex [1], contient la définition de l'ensemble du vocabulaire utilisé dans l'environnement et constitue l'interface entre le vocabulaire de l'utilisateur et le contenu de la base de connaissances et de la base de textes. Par ailleurs, SiLex permet une modélisation plus homogène, car elle favorise un accord entre les concepteurs d'une communauté sur l'acception des termes utilisés. Un prototype de SiLex a été réalisé dans un domaine de la biologie moléculaire.