W3C est dirigé par Jean-François Abramatic, Président et Tim Berners-Lee, Directeur.
Le comité d'orientation du consortium (Advisory Committee) se réunit, physiquement, deux fois par an. Il comprend un représentant de chaque membre. Il joue un rôle consultatif d'évaluation des travaux du dernier semestre et de conseil pour le programme du semestre à venir. Ce comité est également consulté au fil des besoins à l'aide du courrier électronique. Enfin, les trois hôtes réunissent le comité de direction (Steering Committee) pour traiter les questions d'organisation générale (ouverture d'un nouvel hôte, désignation de la structure de management). Ce comité est composé du directeur de MIT-LCS, Michael Dertouzos, du président du consortium, Jean-François Abramatic, du directeur du consortium, Tim Berners-Lee, du président de l'INRIA, Bernard Larrouturou, du doyen de la faculté de l'université de Keio, Nobuo Saito.