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Visualisation de séquences génomiques

 

APIC est une interface graphique qui a pour but de représenter des séquences génomiques et d'en explorer le contenu. Le prototype actuel a été connecté au système PowerGene, permettant ainsi aux utilisateurs de ce système de visualiser et de sélectionner les objets biologiques qui sont produits par les tâches d'analyse de séquences. Sur la base de ce prototype, nous cherchons maintenant à développer de nouvelles collaborations, en particulier avec l'Inra. Le but est d'enrichir notre modèle d'interface en introduisant de nouvelles possibilités de représentation aptes à faciliter le travail d'interprétation des cartes par les biologistes. Ainsi, nous cherchons à modéliser d'autres types de cartes comme les cartes circulaires, ou encore de permettre l'annotation d'objets biologiques par des liens hypertextuels pointant à travers le Web sur des références bibliographiques.