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Ces travaux sont menés conjointement avec le Laboratoire de Biologie Moléculaire et Structurale du CEA-Grenoble (S. Crouzy) et avec le LORIA (O. Coulaud et P.-E. Bernard).
La dynamique moléculaire est une simulation du mouvement des atomes et des molécules par calcul de leurs déplacements. Cette technique est largement utilisée pour simuler les propriétés des solides, des liquides et des gaz. Elle est également employée pour étudier les conformations des macromolécules, et pour la compréhension des mécanismes réactionnels des protéines dans les structures biologiques. Le développement des médicaments de demain sera lié à la compréhension de ces mécanismes.
Ces travaux se mènent en collaboration avec le laboratoire d'astrophysique de Grenoble (P. Valiron) et Guy Fishman (Laboratoire de Spectrométrie physique de Grenoble).
Les problèmes de simulation numérique en chimie ![[*]](../icons/foot_motif.gif){kind=icon}
constituent un
corpus d'applications intéressantes pour le parallélisme. La
mécanique quantique s'applique en particulier à la théorie des
semi-conducteurs. L'un des problèmes que se posent les physiciens
de cette discipline est le calcul des niveaux d'énergie d'une
particule trappée dans un puits de potentiel de géométrie a
priori complexe (pyramidale, en forme de "T"...). Il s'agit
donc de résoudre une équation aux valeurs propres (équation de
Schrödinger) pour un tel potentiel.