Section: Dissemination

Teaching - Supervision - Juries

Teaching

• ESIR: Cédric Meurée, Algorithms and Complexity, 28h, M1, École Supérieure d’Ingénieur de Rennes (ESIR), France

• ESIR: Benoit Combès, Statistiques, 12h, M1, École Supérieure d’Ingénieur de Rennes (ESIR), France

• Master Molecular and Cellular biology/Master Bioinformatics/Master Fundamental and Applied Microbiology: Corentin Vallée, Machine Learning, 64h, M1, Univ. Rennes, France

• L2 informatique: Raphaël Truffet, Génie Logiciel, 24h, L2, ISTIC, France

• ESIR: Pierre Maurel, General image processing (60h), Algorithmics and complexity (60h), Medical imaging (60h), École Supérieure d’Ingénieur de Rennes (ESIR).

• ENS Rennes: Pierre Maurel, Introduction to image processing (24h)

• Licence SIF: Emmanuel Caruyer, Algorithms, 30h, L3, ENS Rennes, France.

• Master 2 "Troubles de la Cognition et du Langage": Pierre-Yves Jonin, Introduction aux méthodes de neuroimagerie pour la recherche en neuropsychologie (3h) Master 2. Université de Poitiers, France.

• Master 2 "Troubles de la Cognition et du Langage": Pierre-Yves Jonin, Evaluation neuropsychologique à visée diagnostique. Le cas des syndromes démentiels. Master 2 (2 x 6h) Université de Poitiers, France.

• Medicine (4th & 5th year) UE Psychologie et Neurobiologie: Pierre-Yves Jonin,L'exploration neuropsychologique des maladies neurologiques et psychiatriques. 4ème & 5àme année de médecine (4h), Université de Brest, France.

• Master 2 Neurosciences Cliniques: Pierre-Yves Jonin, Neurosciences cognitives de la mémoire humaine. Master 2. 3 heures. Université de Rennes 1, France.

• Licence 3 de Psychologie: Pierre-Yves Jonin, Les syndromes neuropsychologiques. L3, (16h) Université de Rennes 2, France

• Licence 3 de Psychologie: Pierre-Yves Jonin, L'approche neuropsychologique du handicap chez les patients cérébro-lésés. Licence 3. Université de Rennes 2.

• Master 2 "Handicap et troubles du développement": Pierre-Yves Jonin, Evaluation neuropsychologique à visée diagnostique. Le cas des syndromes démentiels. Master 2. 2 x 6 heures. Université de Rennes 2.

• Master 2 "Handicap et troubles du développement".: Pierre-Yves Jonin, Méthodologie de la recherche clinique. Master 2. 3 heures. Université de Rennes 2.

• Master 2 "Psychologie, mention Neuropsychologie": Pierre-Yves Jonin, Méthodologie clinique et principes de l’évaluation neuropsychologique à visée diagnostique. Master 2. 3h30. Université de Savoie.

• L2 biologie: Antoine Legouhy, Bio-statistques 34h, L2, Univ. Rennes 1, France.

• M1 mathématiques: Antoine Legouhy, Optimisation 12h, M1, Univ. Rennes 1, France.

• IUT GEA: Mathis Fleury, Mathématiques; 64h (3 months); Licence; IUT Saint-Malo, France.

• L1 INF1: Francesca Galassi, Programming in Java (TD : 20h, TP : 20h), L1, ISTIC University of Rennes 1, France.

• L2 PO: Francesca Galassi, Object Oriented Programming in Java (TP : 20h), L2, ISTIC University of Rennes 1.

• Master SISEA: Benoit Combès, Méthodes statistiques pour l'image 10h, M2, Univ. Rennes 1, France.

• Master SIBM, M2, University of Angers-Brest-Rennes, France.

  • Christian Barillot (Plenary: 12h), responsible for one semester.

  • Jean-Yves Gauvrit, Coordinator for the Master

  • Olivier Commowick (Plenary: 6h).

  • Quentin Duché, “Traitements des données d'IRM fonctionnelle” (Plenary: 1h).

  • Isabelle Corouge, “Bio-marqueurs d’imagerie et IRM metabolique et fonctionnelle” (Plenary: 3h).

  • Camille Maumet, “Imaging processing pipelines” (Plenary: 3h).

  • Élise Bannier, “IRM fonctionnelle BOLD” (Plenary: 3h).

  • Emmanuel Caruyer, “Introduction to diffusion MRI” (Plenary: 3h).

  • Benoit Combès, “Méthodes statistiques pour le traitement d'image” (Plenary: 3h).

Supervision

PhD & HdR

• PhD in progress : Antoine Legouhy, “Longitudinal brain altas creation, application to development studies”, CNRS, from Nov 2016, Christian Barillot, François Rousseau, Olivier Commowick.

• PhD in progress: Cédric Meurée, “Quantitative Analysis Of Arterial Spin Labeling MRI For Robust Parametric Information Of Perfusion Maps”, Inria / Siemens, from Mar 2014, Christian Barillot, Pierre Maurel.

• PhD: Sudhanya Chatterjee, “Gaining insights into brain tissues using multi-compartment T2 relaxometry models”, Inria, defended on Dec 5, 2018, Christian Barillot, Olivier Commowick, Jean-Christophe Ferré, Simon Warfield.

• PhD in progress : Corentin Vallée, “Joint estimation of neuronal activation, resting-state and basal metabolism from Arterial Spin Labeling”, Univ. Rennes, from Nov 2016, Christian Barillot, Isabelle Corouge, Pierre Maurel.

• PhD in progress : Anne-Claire Binter, “Étude des effets possibles des expositions prénatales à des neurotoxiques (solvants organiques et insecticides organophosphorés) sur le fonctionnement du cerveau de l’enfant évalués par imagerie cérébrale (Cohorte Pélagie)”, Univ. Rennes, from Janv 2017, Fabienne Pelé, Cécile Chevrier, Elise Bannier.

• PhD in progress : Xavier Rolland, “Modeling analytic variability in brain imaging”, CNRS, from Oct 2018, Christian Barillot, Camille Maumet.

• PhD in progress : Raphaël Truffet, “Compressed sensing for microstructure-enabled diffusion MRI”, Univ. Rennes / ENS Rennes, from Oct 2018, Christian Barillot, Emmanuel Caruyer.

• PhD: Maia Proisy, “Étude de la perfusion cérébrale par Arterial Spin Labeling en IRM à 1.5T chez le nouveau-né et l'enfant”, Univ. Rennes/CHRU Rennes, defended on Dec 12, 2018, Jean-Christophe Ferré.

• PhD: Anne Kerbrat Univ. Rennes/CHRU Rennes, defended on Oct 24, 2018, Gilles Edan

Other supervisions

• Master student: Solene Tarride, “Deep learning for segmentation of MS lesions from multimodal MRI”, Apr-Oct 2018, Francesca Galassi.

Juries

• Gilles Edan, Jean-Christophe Ferre, Christian Barillot. PhD committee: Anne Kerbrat, Univ. Rennes, Rennes; October 24, 2018.

• Jean-Christophe Ferre, Christian Barillot. PhD committee: Maia Proisy, Univ. Rennes, Rennes; December 12, 2018.

• Jean-Christophe Ferre, Christian Barillot. PhD committee: Jean-Marie Batail, Univ. Rennes, Rennes; December 15, 2018.

• Olivier Commowick, Christian Barillot. PhD committee: Sudhanya Chatterjee, Inria, Rennes; December 5, 2018.

• Isabelle Corouge, PhD thesis in medicine committee: Christophe Paya, Univ. Rennes, Rennes; June 25, 2018.

• Isabelle Corouge, PhD mid-term committee (CSI) : Cédric Meurée, Rennes; May 2018.

• Élise Bannier, PhD mid-term committee (CSI) : Haykel Snoussi, Rennes; May 2018.

• Élise Bannier, PhD mid-term committee (CSI) : Louis Marage, Rennes; July 2018.

• Emmanuel Caruyer, PhD mid-term committee (CSI) : Sudhanya Chatterjee, Rennes; June 2018.

• Christian Barillot, PhD committee: Gaetan Galisot, Tours Université Tours, March 21, 2018

• Christian Barillot, PhD review: Pauline Bezivin-Frere, Orsay Université Paris X, July 4, 2018

• Christian Barillot, Chairman PhD committee: Mayela Toledo, Rennes Université Rennes 1, May 23, 2018