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  • The Inria's Research Teams produce an annual Activity Report presenting their activities and their results of the year. These reports include the team members, the scientific program, the software developed by the team and the new results of the year. The report also describes the grants, contracts and the activities of dissemination and teaching. Finally, the report gives the list of publications of the year.

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Section: Dissemination

Teaching - Supervision - Juries

Teaching

  • Licence: Samuel Bernard: Algèbre Linéaire, 15h, L3, INSA

  • Licence: Samuel Bernard: EDO-EDP, 15h, L3, INSA

  • Licence : Ronan Duchesne, Anglais, 5h, L3

  • Licence : Ronan Duchesne, Modélisation des systèmes biologiques, 22h, L3

  • Licence : Ronan Duchesne, Bioinformatique, 20h, L3

  • Licence : Ronan Duchesne, Développement, 4h, L3

  • Licence : Simon Girel, Fondamentaux des mathématiques 1, 86h, L1, Université Lyon 1, France

  • Licence : Simon Girel, Introduction à l'analyse numérique, 10h, L1, Université Lyon 1, France

  • Licence: Laurent Pujo Menjouet, Fondamentaux des mathématiques I, 138h EQTD, L1, UCBL 1, FRANCE

  • Licence: Laurent Pujo Menjouet, Introduction à l’analyse numérique, 62h EQTD, L2, UCBL 1, FRANCE

  • Licence: Laurent Pujo Menjouet, bio-mathématiques et modélisation BISM, 10.5h EQTD, L3 UCBL 1, FRANCE

  • Licence: Laurent Pujo Menjouet, 3ème année biosciences BIM: EDO, 35h EQTD, INSA Lyon, FRANCE

  • Licence : L. M. Tine, Techniques mathématiques de base, 53h (EqTD), niveau L0, Lyon 1, France.

  • Licence : L. M. Tine, Techniques mathématiques de base, 62h (EqTD), niveau L1, Lyon 1, France.

  • Licence : L. M. Tine, Initiation LaTex+ stage, 12h (EqTD), niveau L3, Lyon 1, France.

  • Master : Samuel Bernard, Population Dynamics, 36h ETD, M2, UCBL, Lyon.

  • Master : Mostafa Adimy, Population Dynamics, 9h ETD, M2, UCBL, Lyon.

  • Master : Mostafa Adimy, Epidemiology, 12h ETD, M2, UCBL, Lyon.

  • Master : Ronan Duchesne, Biologie du développement, 12h, M1

  • Master : Ronan Duchesne, Statistiques, 2h, M1

  • Master : Ronan Duchesne, Adaptation, 2h, M1

  • Master : Ronan Duchesne, Practicals in statistics and modelling for the biosciences, 28h, M2

  • Master: Thomas Lepoutre, préparation à l'option pour l'agrégation, 45 h eq TD, M2 UCBL 1, FRANCE

  • Master: Laurent Pujo Menjouet, maths appliquées et statistiques: Systèmes dynamiques, 78h EQTD, M1, UCBL 1, FRANCE,

  • Master: Laurent Pujo Menjouet, master modélisation des systèmes complexes: modelling biology and medicine, M2, 9h EQTD, ENS-Lyon, FRANCE

  • Master: Laurent Pujo Menjouet,INSA 4ème année biosciences BIM: ED-EDP, 22h EQTD, M1 INSA Lyon, FRANCE

  • Master: L. M. Tine, Maths en action, Remise à niveau analyse, 12h (EqTD), niveau M2, Lyon 1, France.

  • Master: L. M. Tine, Maths en action, épidémiologie, 18h (EqTD), niveau M2, Lyon 1, France.

Supervision

  • PhD in progress: Aurélien Canet, “Contribution à l’étude de la quantification de la réponse d’une tumeur solide après un traitement par radiothérapie”, Université Lyon, since January 2016, encadrants: Larry Bodgi, Nicolas Foray and Laurent Pujo Menjouet.

  • PhD in progress: Kyriaki Dariva , "Modélisation mathématique des interactions avec le système immunitaire en leucémie myéloide chronique". Université Lyon 1, September 2018, supervisor : Thomas Lepoutre

  • PhD in progress: Ronan Duchesne, “Vers un modèle multi-échelle de la différentiation cellulaire : Application à la différentiation érythrocytaire”, École normale supérieure de Lyon and Université Lyon 1, since September 2016, supervisors: Olivier Gandrillon and Fabien Crauste.

  • PhD in progress: Alexey Koshkin, Inferring gene regulatory networks from single cell data , ENS de Lyon, since September 2018, supervisors : Olivier Gandrillon and Fabien Crauste.

  • PhD in progress : Paul Lemarre, " Modélisation des souches de prions". Université Lyon 1, since May 2017, supervisors Laurent Pujo Menjouet et Suzanne Sindi (University of California, Merced)

  • PhD : Arnaud Bonnafoux, Vers une inférence automatique de réseaux de gènes dynamiques à partir de « mégadonnées » temporelles discrètes acquises sur cellules uniques, Université Lyon 1, October 2018, Olivier Gandrillon (CIFRE with the COSMOTECH).

  • PhD : Loïs Boullu, Modélisation de la mégacaryopoïèse et applications aux maladies liées â la production des plaquettes, Université Lyon 1, November 2018, Laurent Pujo Menjouet and Jacques Bélair (co-tutelle avec l'Université de Montréal).

  • PhD : Simon Girel, Modélisation de la réponse immunitaire T CD8 : analyse mathématique et modèles multi-échelles, Université de Lyon, November 2018 , encadrant: Fabien Crauste.

  • PhD : Ulysse Herbach, Modèles graphiques probabilistes pour l’inférence de réseaux de gènes, Université Lyon 1, September 2018, Olivier Gandrillon, Thibault Espinasse (ICJ) and Anne-Laure Fougères (ICJ).

Juries

We separate the juries of team members from external participations. PhD Defense within the team in 2018

  • Arnaud Bonnaffoux (O. Gandrillon supervisor),

  • Lois Boullu (L. Pujo Menjouet supervisor, M. Adimy and F. Crauste examiners),

  • Ulysse Herbach (O. Gandrillon supervisor)

  • Simon Girel (F. Crauste supervisor L. Pujo Menjouet examiner).

  • M. Adimy: PhD of Linlin Li, Mathematical analysis of a model of partial differential equations describing the adaptation of mosquitoes facing the usage of insecticides, University of Bordeaux, reviewer.

  • M. Adimy: PhD of Zhengyang Zhang, A class of state-dependent delay differential equations and applications to forest growth, University of Bordeaux, examiner.

  • V. Volpert: PhD of Guillaume Cantin, Étude de réseaux complexes de systèmes dynamiques dissipatifs ou conservatifs en dimension finie ou infinie. Application à l’analyse des comportements humains en situation de catastrophe. Université Le Havre Normandie, examiner.

  • S. Bernard : Charles Rocabert, Etude de l'évolution de micro-organismes bactériens par des approches de modélisation et de simulation informatique, INSA Lyon, (examiner)