Section: Dissemination

Teaching - Supervision - Juries

Teaching

• Master: Grégory Batt (coordinator and teacher: 35h) and Jakob Ruess (25h), Computational Biology, M1, Master Approches Interdisciplinaires du Vivant (AIV).

• Master: Grégory Batt (3h) Synthetic Biology and Control course in Molecular and Cellular Biology Sorbonne Université, Paris.

• Master: François Fages (coordinator module 24h and teacher 12h) C2-19 Biochemical Programming, Master Parisien de Recherche en Informatique (MPRI), Paris.

• Master: François Fages (co-coordinator module 36h and teacher 18h) and Sylvain Soliman (co-coordinator, teacher 18h) INF555 - Constraint-based Modeling and Algorithms for Decision Making Problems Master Artificial Intelligence, Ecole Polytechnique.

• Master Modélisation en Pharmacologie Clinique et Epidémiologie Villejuif. François Fages (3h) Méthodes de modélisation informatique des processus cellulaires: cycle cellulaire et horloge circadienne,

• Bachelor 2: Eléonore Bellot (teacher 64h) CSE201 Object-oriented Programming in C++ TD and project supervision

• Thematic Research School: Advances in systems and synthetic biology, Evry. François Fages and Sylvain Soliman (3h) BIOCHAM Workshop

Supervision

• PhD in progress: Virgile Andreani, Calibration efficace de modèles de résistance bactérienne aux antibiotiques à l’aide d’un plan d’expériences optimal, ED STIC, Ecole Polytechnique, Sept. 2016, Gregory Batt

• PhD in progress: Sebastian Sosa, “Understanding cost of protein production in yeast”, ED FdV, Université Sorbonne Paris Cité, Feb. 2018, Gregory Batt

• PhD in progress: Chetan Aditya, “Control of heterogenous synthetic microbial systems”, ED FdV, Université Sorbonne Paris Cité, Feb. 2018, Gregory Batt

• PhD in progress: Elise Weill, “Optimal control of partial differential equation systems: Application to heterogeneous cell populations”, ED STIC, Ecole Polytechnique, Oct. 2018, Frédéric Bonnans and Gregory Batt

• PhD in progress: Arthur Carcano, “Iterative design of single-cell experiments to learn single-cell models of biological systems”, ED FdV, Université Sorbonne Paris Cité, Oct. 2018, Jakob Ruess and Gregory Batt

• PhD in progress : Eléonore Bellot, “Réduction de modèles différentiels par résolution de contraintes d’algèbre tropicale (min,+)”, ED STIC, Ecole Polytechnique, Sept. 2018, F. Fages & S. Soliman (50-50%)

• PhD in progress : Jérémy Grignard, “Apprentissage de modèles à partir de données pour la conception d’expériences de criblage et la recherche de médicaments”, ED STIC, Ecole Polytechnique, dec. 2018, F. Fages & T. Dorval, Servier (50-50%)

• PhD in progress : Julien Martinelli, “Apprentissage de modèles mécanistes à partir de données temporelles, application à la personnalisation de la chronothérapie des cancers”, ED STIC, Ecole Polytechnique, oct. 2018, F. Fages & A. Ballesta, Inserm (50-50%)

• Master's Thesis in progress : Elisabeth Degrand, “Evolving Chemical Reaction Networks”, KTH Stockholm, Sweden, F. Fages & M. Hemery (50-50%)

Juries

• Grégory Batt participated in the jurys of

  • HdR of Benjamin Pfeuty, Université de Lille, Rapporteur, 23/11/2018

  • PhD of Arnaud Bonnaffoux, ENS de Lyon, Président du Jury, 12/10/2018

  • PhD of Alexandre Deloupy, Sorbonne Université, Rapporteur, 14/12/2018

• François Fages participated in the jurys of

  • HDR Thi Bich Han Dao, Université d'Orléans, Président du jury, 14 mars 2018.

  • PhD Alexandre Rocca, Université Grenoble, Rapporteur, 7 mai 2018.

  • PhD Benjamin Miraglio, Université de Nice, Rapporteur, 16 février 2018.

• Jakob Ruess was member of the jury of the PhD thesis of Mathieu Pichené, 25/06/2018.